Ligand-Protein Interaction Of 3-(1-(3-Hydroxypropylamino)Etylidene)Chroman-2,4-Dione With Human C Reactive Protein
Ligand-protein interakcije 3-(1-(3-hidroksipropilamino)etiliden)hroman-2,4-diona sa humanim C reaktivnim proteinom
2018
Autori
Avdović, EdinaMilenković, Dejan
Djorović, Jelena
Vuković, Nenad
Dolicanin, Zana
Trifunović, Srećko
Marković, Zoran
Jeremić, Svetlana
Konferencijski prilog (Objavljena verzija)
Metapodaci
Prikaz svih podataka o dokumentuApstrakt
The structure of the newly synthesized coumarin derivative, 3-(1-(3-hydroxypropylamino)-ethylidene)-chroman-2,4-dione, was investigated theoretically. The density functional theory calculations, with B3LYP functional (and with empirical dispersion corrections D3BJ) in combination with the 6–311+G(d,p) basis set, are performed in order to optimized the molecular structure of the investigated coumarin derivative. Molecular docking analysis was carried out in order to identify the potency of inhibition of the title molecule against human C-reactive protein. The inhibition activity was obtained for ten conformations of ligand inside protein.
Struktura novo sintetisanog derivata kumarina, 3- (1- (3-hidroksipropilamino) -etiliden) -hroman-2,4-diona, ispitana je primenom teorijskih metoda. Za optimizaciju strukture ispitivanog kumarinskog derivata korišćena je teorija funkcionalne gustine: B3LYP funkcional ( sa empirijskim ispravkama disperzije D3BJ) u kombinaciji sa 6-311+G(d, p) bazisnim setom. Urađen je molekulski doking, kao i analiza dobijenih rezultata kako bi se utvrdio potencijal inhibicije molekula ispitivanog jedinjenja prema humanom C-reaktivnom proteinu. Aktivnost inhibicije izračunata je za deset potencijalnih konformacija liganda unutar proteina.
Ključne reči:
3-(1-(3-hydroxypropylamino)ethylidene)chroman-2,4-dione / CRP / Molecular docking / molekulski dokingIzvor:
23. Savetovanje o biotehnologiji sa međunarodnim učešćem, Čačak, 09.-10. 03. 2018., 2018Finansiranje / projekti:
- Dinamika nelinearnih fizičkohemijskih i biohemijskih sistema sa modeliranjem i predviđanjem njihovih ponašanja pod neravnotežnim uslovima (RS-172015)
- Sinteza, modelovanje, fizičko-hemijske i biološke osobine organskih jedinjenja i odgovarajućih kompleksa metala (RS-172016)
- Metode modeliranja na više skala sa primenama u biomedicini (RS-174028)
Institucija/grupa
Poljoprivredni fakultetTY - CONF AU - Avdović, Edina AU - Milenković, Dejan AU - Djorović, Jelena AU - Vuković, Nenad AU - Dolicanin, Zana AU - Trifunović, Srećko AU - Marković, Zoran AU - Jeremić, Svetlana PY - 2018 UR - http://aspace.agrif.bg.ac.rs/handle/123456789/5654 AB - The structure of the newly synthesized coumarin derivative, 3-(1-(3-hydroxypropylamino)-ethylidene)-chroman-2,4-dione, was investigated theoretically. The density functional theory calculations, with B3LYP functional (and with empirical dispersion corrections D3BJ) in combination with the 6–311+G(d,p) basis set, are performed in order to optimized the molecular structure of the investigated coumarin derivative. Molecular docking analysis was carried out in order to identify the potency of inhibition of the title molecule against human C-reactive protein. The inhibition activity was obtained for ten conformations of ligand inside protein. AB - Struktura novo sintetisanog derivata kumarina, 3- (1- (3-hidroksipropilamino) -etiliden) -hroman-2,4-diona, ispitana je primenom teorijskih metoda. Za optimizaciju strukture ispitivanog kumarinskog derivata korišćena je teorija funkcionalne gustine: B3LYP funkcional ( sa empirijskim ispravkama disperzije D3BJ) u kombinaciji sa 6-311+G(d, p) bazisnim setom. Urađen je molekulski doking, kao i analiza dobijenih rezultata kako bi se utvrdio potencijal inhibicije molekula ispitivanog jedinjenja prema humanom C-reaktivnom proteinu. Aktivnost inhibicije izračunata je za deset potencijalnih konformacija liganda unutar proteina. C3 - 23. Savetovanje o biotehnologiji sa međunarodnim učešćem, Čačak, 09.-10. 03. 2018. T1 - Ligand-Protein Interaction Of 3-(1-(3-Hydroxypropylamino)Etylidene)Chroman-2,4-Dione With Human C Reactive Protein T1 - Ligand-protein interakcije 3-(1-(3-hidroksipropilamino)etiliden)hroman-2,4-diona sa humanim C reaktivnim proteinom UR - https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_agrospace_5654 ER -
@conference{ author = "Avdović, Edina and Milenković, Dejan and Djorović, Jelena and Vuković, Nenad and Dolicanin, Zana and Trifunović, Srećko and Marković, Zoran and Jeremić, Svetlana", year = "2018", abstract = "The structure of the newly synthesized coumarin derivative, 3-(1-(3-hydroxypropylamino)-ethylidene)-chroman-2,4-dione, was investigated theoretically. The density functional theory calculations, with B3LYP functional (and with empirical dispersion corrections D3BJ) in combination with the 6–311+G(d,p) basis set, are performed in order to optimized the molecular structure of the investigated coumarin derivative. Molecular docking analysis was carried out in order to identify the potency of inhibition of the title molecule against human C-reactive protein. The inhibition activity was obtained for ten conformations of ligand inside protein., Struktura novo sintetisanog derivata kumarina, 3- (1- (3-hidroksipropilamino) -etiliden) -hroman-2,4-diona, ispitana je primenom teorijskih metoda. Za optimizaciju strukture ispitivanog kumarinskog derivata korišćena je teorija funkcionalne gustine: B3LYP funkcional ( sa empirijskim ispravkama disperzije D3BJ) u kombinaciji sa 6-311+G(d, p) bazisnim setom. Urađen je molekulski doking, kao i analiza dobijenih rezultata kako bi se utvrdio potencijal inhibicije molekula ispitivanog jedinjenja prema humanom C-reaktivnom proteinu. Aktivnost inhibicije izračunata je za deset potencijalnih konformacija liganda unutar proteina.", journal = "23. Savetovanje o biotehnologiji sa međunarodnim učešćem, Čačak, 09.-10. 03. 2018.", title = "Ligand-Protein Interaction Of 3-(1-(3-Hydroxypropylamino)Etylidene)Chroman-2,4-Dione With Human C Reactive Protein, Ligand-protein interakcije 3-(1-(3-hidroksipropilamino)etiliden)hroman-2,4-diona sa humanim C reaktivnim proteinom", url = "https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_agrospace_5654" }
Avdović, E., Milenković, D., Djorović, J., Vuković, N., Dolicanin, Z., Trifunović, S., Marković, Z.,& Jeremić, S.. (2018). Ligand-Protein Interaction Of 3-(1-(3-Hydroxypropylamino)Etylidene)Chroman-2,4-Dione With Human C Reactive Protein. in 23. Savetovanje o biotehnologiji sa međunarodnim učešćem, Čačak, 09.-10. 03. 2018.. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_agrospace_5654
Avdović E, Milenković D, Djorović J, Vuković N, Dolicanin Z, Trifunović S, Marković Z, Jeremić S. Ligand-Protein Interaction Of 3-(1-(3-Hydroxypropylamino)Etylidene)Chroman-2,4-Dione With Human C Reactive Protein. in 23. Savetovanje o biotehnologiji sa međunarodnim učešćem, Čačak, 09.-10. 03. 2018.. 2018;. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_agrospace_5654 .
Avdović, Edina, Milenković, Dejan, Djorović, Jelena, Vuković, Nenad, Dolicanin, Zana, Trifunović, Srećko, Marković, Zoran, Jeremić, Svetlana, "Ligand-Protein Interaction Of 3-(1-(3-Hydroxypropylamino)Etylidene)Chroman-2,4-Dione With Human C Reactive Protein" in 23. Savetovanje o biotehnologiji sa međunarodnim učešćem, Čačak, 09.-10. 03. 2018. (2018), https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_agrospace_5654 .